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药明康德HitS事业部等在Nature Reviews Methods Primers发表DEL引领性综述

近日，Nature系列期刊NatureReviews Methods Primers邀请DEL领域知名科学家共同撰写了题为 “DNA-encoded chemical libraries” (DNA编码化合物库)的领域引导性综述*，并于该刊2022年第一期发表。

 

 

*药明康德HitS事业部AlexanderL.Satz博士和蒯乐天博士

多特蒙德大学化学生物学Andreas Brunschweiger博士

辉瑞药物研究所Mark E. Flanagan博士

苏黎世联邦理工大学Andreas Gloger教授

Vipergen ApS公司Nils J. V. Hansen博士

Serengen公司Verena B. K. Kunig博士

中国科学院上海药物研究所陆晓杰研究员

葛兰素史克Lisa A. Marcaurelle博士

艾伯维Gary O’Donovan博士

 

Nature Reviews Primers综述通常围绕一个重要主题，邀请跨地区跨学科的多名顶尖学者合作撰写，旨在面向更为广泛的读者，概述该主题相关方向的发生发展、方法与应用。

 

该引导性综述论文概述了DEL库的设计、构建、纯化、质控和DNA兼容新反应的开发等方法，DEL筛选的过程，DEL筛选的成果，以及DEL技术的应用场景，并且对于不同DEL实验再现性和筛选数据冗余等问题进行了分析论述。

亲和筛选流程

 

目前，DEL技术可用于核酸类、可溶性蛋白和膜融合蛋白等药物靶点，可模拟生理环境进行筛选，与机器学习联合筛选等。同时，本文也讨论了DEL技术可优化的方向，例如分子砌块的多样性、建库原料的生产、运输、储存等流程的稳定性和成本管理，以及分子砌块在化合物验证和转化率之间的平衡等，并提出了可能的解决方案，如全球范围内跨实验室合作，或者高通量平行合成新的分子砌块，跳过纯化和表征环节直接用于库生产。

 

DEL的应用领域

 

论文对DEL面临的一些挑战和未来发展提出了设想，如：

  • 能否在细胞层面直接筛选，从而解决靶蛋白溶解性问题？

  • 能否通过引入更高通量、自动化的合成步骤，或者与机器学习等新技术整合，有效监测与鉴别建库副产物？

  • 为拓展DEL库所包含的化学空间，仍需重视新型分子砌块和DNA兼容化学反应的开发。

 

百尺竿头，更进一步，我们期待这篇发表于DEL技术诞生三十年之际的论文，能够推动这一技术取得更多的成绩和进展，吸引不同专业背景的学者加入，催生更多的理论与技术创新，共同推动DEL技术在交叉学科领域中的应用与突破。